Herzstück der neuen KTM 990 RC R ist der überarbeitete Zweizylinder-Reihenmotor LC8c mit 947 Kubikzentimetern Hubraum. Das Triebwerk erfüllt die Euro-5+-Norm, leistet 130 PS und liefert ein maximales Drehmoment von 103 Newtonmetern. Mit einem Trockengewicht von 57 Kilogramm gehört das Aggregat zu den leichtesten seiner Klasse. Es ist in einen neu entwickelten Stahlrohrrahmen mit angeschraubtem Aluminium-Heckrahmen integriert. Hohe Fahrstabilität beim Beschleunigen stand im Fokus der Chassis-Entwicklung.
Bei den Federelementen setzt KTM auf voll einstellbare WP-Apex-Komponenten. Verzögert wird mit Brembo-Material: Vorne arbeitet eine 320er Doppelscheibe mit Vierkolben-HyperPure-Sätteln, im Heck eine Einzelscheibe. Vier ABS-Programme – Street, Sport, Supermoto+ und Supermoto – passen die Regelintensität an unterschiedliche Einsatzzwecke an.
