Die auffälligsten Neuerungen an der MT-03 finden sich an der Front des Motorrads. Dort löst eine 37-mm-USD-Gabel die bisher verwendete konventionelle Telegabel ab. Die neue Frontmaske trägt einen LED-Scheinwerfer und zwei Positionslichter, außerdem zeigen LED vorn und hinten einen Fahrtrichtungswechsel an. In die Maske integriert ist ein neues LCD-Multiinstrument, das seine Informationen weiß auf schwarz wiedergibt.
Der Tank fasst weiterhin 14 Liter, ist aber neu geformt und soll zusammen mit der niedrigeren Sitzposition und dem höher montierten Lenker den Fahrer besser ins Motorrad integrieren. Zu guter Letzt erhielt das hintere Zentralfederbein eine überarbeitete Dämpfung und eine steifere Feder.